انعقد بعد قيام ثورتي 8 شباط في العراق و 8 آذار في سورية عام 1963, ويعد أهم مؤتمر قومي بعد المؤتمر التأسيسي لأنه انعقد بعد وصول الحزب إلى السلطة. وحضره القائد الخالد حافظ الأسد ودعم التوجه نحو إقرار (بعض المنطلقات النظرية) وقاوم التوجه اليميني.
- من مقرراته:
1. أقر بعض المنطلقات النظرية.
2. أقر الأسس النظرية للانطلاق في نظرية الثورة.
3. حول قضايا النضال العربي أقر إقامة وحدة اتحادية ثنائية بين سورية والعراق.
4. أكد مبدأ القيادة الجماعية (تأكيد مبدأ الديمقراطية المركزية).
5. اعتماد العمال والفلاحين كقاعدة للثورة وللحزب في آن واحد.
6. علاقة الحزب بالسلطة (ضرورة تميز الحزب عن الدولة).
7. إنشاء جبهة عربية تقدمية على صعيد الوطن العربي.
8. استمرار الكفاح الدائم ضد الاستعمار.
9. تأكيد سياسة عدم الالتزام بالمعسكرات الدولية.
10. تعزيز الصداقة مع شعوب العالم الاشتراكي.
11. تعزيز التضامن مع بلدان العالم الثالث.
12. محاربة جميع أنواع التمييز العنصري في العالم.
13. انتخاب قيادة قومية جديدة تتألف من:
- الأمين العام من سورية.
- 3 من القطر السوري.
- 5 من القطر العراقي.
- 2 من لبنان.
- 2 من الأردن.